Valentin073 a écrit :
comment font-ils pour obtenir seulement le type de séquence qu'il veulent ? ARNr, ADNmt, COX, etc... ????
Il y a des enzymes qui ne ciblent que certains gènes ou type d'acide génomique ?
Pour cela, on utilise des amorces spécifiques au
gène d'intérêt, l'une au tout début et l'autre à la fin du
gène (quand c'est possible...).
Ces amorces sont de toutes petites séquences (20-30 nucléotides) qui sont généralement situées dans des zones qui évoluent un peu moins vite que les autres, et qui sont donc relativement bien conservées d'une espèce à l'autre (enfin, entre un parpaillon et l'homme, ça risque de marcher moins bien forcément
).
Ensuite, on fait une PCR (Polymerase Chain Reaction) pour amplifier la séquence d'intérêt comprise entre ces amorces/bornes.
Et quand on a suffisamment amplifier la séquence d'intérêt, on peut la faire séquencer
Le choix des amorces est très important, elles doivent être suffisamment spécifiques au
gène d'intérêt, sinon la PCR amplifiera plusieurs séquences à la fois et le séquençage n'en donnera aucune de lisible
Tout ceci constitue la
base de la biologie moléculaire
C'est ainsi que le
gène CoxI,
gène "universel" désigné pour le grand projet de barcoding (objectif: telle séquence CoxI correspond à telle espèce du vivant et aucune autre) est en général déterminé
D'une manière générale, ça marche assez bien (mais comme partout, il y a des groupes de bestioles où c'est un peu limite...)
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